携手华大基因,国家先进计算太原中心高效破译生命密码

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2024-07-09 15:22:34·[??中关村在线原创??]·作者：科技快讯

近日,记者从国家先进计算太原中心获悉,为践行山西省发改委发布的《生物经济发展中长期规划(2023-2035年)》,大力支持生物技术赋能经济社会发展,国家先进计算太原中心帮助华大基因在先进计算平台上对第三代测序软件进行移植,构建起高效的生物分析计算流程与存储方案。

“中心在计算能力和数据处理方面的专业性令人印象深刻,极大地提高了科研工作效率。”华大基因业务负责人,对国家先进计算太原中心称赞道。

图说:国家先进计算太原中心

国家先进计算太原中心(以下简称“太原中心”),是由山西省委、省政府推动建设的信息化基础设施。太原中心依托“算力+算法+算据”综合体系,不仅支持生物基因技术等前沿科学发展,还为工业仿真、大数据处理、人工智能等领域,注入了先进计算的强劲动力,成为推动科技进步与产业升级的重要引擎。

澎湃存、算力,支持5000个作业高并发

生物科学领域,一直对存、算能力有着极高的要求。例如,人体全基因组测序每天生产的数据约为1-6TB,要分析这些数据,不仅提交计算任务数量多,且单个核心计算任务时长不定,这就要求计算资源必须具备足够多的物理核心和存储空间。

为此,太原中心提供了万余核心的动态共享资源及10+个独占节点;在存储方面,提供了数百TB的分布式存储和Gbps级专线。通过动态节点与独占节点混合方式,确保了在处理大量小核心任务时,仍能维持计算资源的最优配置,最高支持并发作业可达5000个。以灵活性与高效性的存算资源调度,满足了科研工作中对高并发、高内存需求的严苛标准。

适配调优+便捷管理,让算力好用易用

生物信息数据分析软件众多,软件的运行环境也十分繁杂。为保障计算资源易用性,太原中心完成专业软件在国产平台上的适配,并针对性优化计算流程,构建起DNA测序、人类全基因组重测序、RNA-Seq等十余种业务模式,满足了科研工作的多样需求。

此外,太原中心通过智能管理平台整合资源,搭建起统一且便捷的使用界面,并引入脚本、模板及图形化提交等灵活的作业提交方式。不仅简化了用户操作,也有效解决了软件管理和使用的难题。

国家先进计算太原中心正以强大的算力资源、精细化的服务模式,不仅加速了生物科学的探索步伐,也为工业设计、气动模拟、类脑智能科学、政务大数据处理等应用提供了算力支撑,有力推动了我国科研进步和创新发展。